Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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