Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms