Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms