Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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