Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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