Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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SEMA3BQ13214 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3BQ13214 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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