Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms