Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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