Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MSI1O43347 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MSI1O43347 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MSI1O43347 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MSI1O43347 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MSI1O43347 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MSI1O43347 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms