Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CLIP4Q8N3C7 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLIP4Q8N3C7 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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