Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CCDC96Q2M329 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CCDC96Q2M329 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CCDC96Q2M329 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CCDC96Q2M329 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CCDC96Q2M329 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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