Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IMPG1Q17R60 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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