Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CA9Q16790 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CA9Q16790 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms