Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms