Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC008738.6-201ENST00000604605 569 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL391666.1-201ENST00000442570 2764 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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