Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms