Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms