Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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