Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C9orf16Q9BUW7 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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