Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 ARL17B-201ENST00000434041 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 ARL17A-203ENST00000445552 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NREPQ16612 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms