Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FXNQ16595 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms