Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTCH1Q13635 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTCH1Q13635 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTCH1Q13635 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTCH1Q13635 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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