Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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