Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms