Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLDN9O95484 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms