Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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