Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 PYHIN5P-201ENST00000431627 723 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-206ENST00000394153 2374 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms