Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms