Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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