Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ITGA9Q13797 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ITGA9Q13797 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ITGA9Q13797 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ITGA9Q13797 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ITGA9Q13797 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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ITGA9Q13797 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ITGA9Q13797 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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