Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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