Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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NME3Q13232 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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NME3Q13232 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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NME3Q13232 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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