Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms