Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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HOXD8P13378 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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HOXD8P13378 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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