Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1BQ9UPS6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms