Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms