Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPN3Q9UHW5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPN3Q9UHW5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms