Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms