Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms