Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD1Q8NA66 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms