Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms