Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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