Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms