Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms