Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms