Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms