Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMA3P25788 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA3P25788 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms