Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD8P13378 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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