Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01837 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01837 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01837 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01837 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01837 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01837 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01837 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01837 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms