Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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